健診の案内にマイキンソー プロのチラシが挟まれていた。そんな経験はありませんか？
広告で自宅版を見かけて、「医療機関のプロ版のほうが安心では」と迷う方は少なくありません。
「プロ」と名前がつく以上、プロ版のほうが高性能。そう思っていませんか？
これは誤解です。
マイキンソーとプロの違いは5点。購入場所・価格・疾患リスク判定・専門家解説・レポート項目数だけです。
検査基盤（16S rRNA解析）は共通で、測っている菌にも解析精度にも差はありません。
「プロ＝上位版」ではなく、「プロ＝医療機関向けパッケージ」と捉えるのが正確です。
迷ったら初手は自宅版で十分。19,800円（税込）で、3〜4週間後には自分の腸内が数値で見えます。
↓まず腸内を数値化するなら
検査基盤はプロ版と共通・通販で完結
- 解析技術はプロ版と共通の16S rRNA解析
- 19,800円（税込）で通販完結・追加料金なし
- 約3〜4週間で20項目以上の結果レポートが届く
＼通販完結で医療機関より手軽／
【結論】マイキンソーとマイキンソープロの違いは5つ
マイキンソーとプロの違いは、購入場所・価格・疾患リスク判定・専門家解説・レポート項目数の5点です。
検査基盤そのものは共通のため、「プロ版のほうが精度が高い」という誤解はここで解いてください。
サイキンソー社は自宅版・プロ版ともに、同じシーケンサー（イルミナ社MiSeq System）で16S rRNA遺伝子を解析しています。
測っている菌も、解析技術も同じ。違うのは「どこで買うか」「料金体系」「結果レポートに何が含まれるか」の3点だけです。
5つの軸で並べると、自宅版とプロ版の差がはっきりします。
| 比較項目 | マイキンソー（自宅版） | マイキンソー プロ |
|---|---|---|
| 購入場所 | 公式通販・Amazon・楽天・一部ドラッグストア | 医療機関・健診センター限定 |
| 価格 | 19,800円（税込）固定 | 22,000〜30,000円前後（施設ごと） |
| 疾患リスク判定 | なし | 4項目あり（IBS・高血圧・糖尿病・大腸がん） |
| 専門家解説 | なし（Webレポートのみ） | 医師・管理栄養士のアドバイスあり |
| レポート項目数 | 20項目＋アドバイス | 20項目＋疾患リスク＋紙レポート＋ガイド冊子 |
検査技術そのもの（16S rRNA解析）は共通です。プロ版を「上位版」と捉えている方は、この前提からズレが生まれています。
購入場所（通販と医療機関）
自宅版は通販で誰でも買えますが、プロ版は医療機関でしか受けられません。この1点だけでも、プロ版のハードルは一段上がります。
自宅版の購入先は、マイキンソー公式通販（store.mykinso.com）、Amazon、楽天、ドラッグストアのココカラファインなど。思い立った日にスマホで注文できます。
一方、プロ版は全国の医療機関・健診センターでの実施が前提です。
サイキンソー社の公表では、導入施設は全国1,500件（2025年時点）あります。個人が通販でプロ版キットだけを購入することは、原則できません。
つまり、受けるまでの行動コストが違います。
「自宅でサクッと始めたい」のか「通院してでも医師と一緒に見たい」のか、ここが第1の分かれ道です。
価格レンジ（自宅版とプロ版）
自宅版は19,800円の一本価格、プロ版は医療機関ごとに22,000〜30,000円前後と幅があります。
自宅版は公式通販で19,800円（税込）。Amazonでも楽天でも同じ19,800円が定価で、チャネルによる大きな差はありません。
プロ版は自費診療扱いのため、料金は医療機関が設定します。
公開されている例としては、ライフクリニック蓼科（長野）が22,000円（税込・栄養指導含む）。プロ単独で実施する場合は、別途「単独実施料」3,500円が加算されます。
医療機関によっては30,000円前後まで上がるケースもあります。
ネットで「プロ版19,800円〜」と書いている記事を見かけますが、実際の公開料金を確認した限り、22,000円が下限の実態です。
基本的にプロ版のほうが高い。これが第2の違いです。
疾患リスク判定の有無
プロ版だけが「疾患別のリスク判定」を備えています。対象は4項目。ここがプロ版の最大の差別化要素です。
プロ版のリスク判定対象は、過敏性腸症候群（IBS）・高血圧・糖尿病・大腸がんの4つ。たまプラーザ南口胃腸内科クリニックなど、導入施設の公開情報で確認できます。
自宅版にこの判定はありません。
代わりに「腸内フローラ判定（A〜Eの5段階）」と個別菌のスコア、腸活アドバイスが提供されます。
ただし、注意点が1つあります。
プロ版の疾患リスク判定は「腸内フローラと生活習慣アンケートから算出した統計的な傾向」であって、医学的な確定診断ではありません。
専門家による解説の有無
プロ版は医師・管理栄養士のアドバイスつき、自宅版は自分で結果を読む形式です。「誰かに解説してほしい」かどうかで判断が分かれます。
プロ版では、検査を受けた医療機関の医師や管理栄養士から、結果に基づく生活習慣アドバイスを受けられます。施設によっては栄養指導が検査料金に含まれます。
サイキンソー社がプロ版受検者向けに提供する無料コールセンター「腸活ご相談コール」も利用可能。管理栄養士に電話で質問できる仕組みです。
自宅版には対面の専門家解説はありません。結果はマイページで閲覧し、付属のアドバイスを自分で読み解く形式です。
ただし、マイページのコンテンツ自体は充実しており、腸活初心者でも理解できるよう設計されています。
レポート項目数と内容の差
自宅版も20項目で十分ですが、プロ版には疾患リスク判定と紙レポート、ガイド冊子が追加されます。差がつくのは「結果の見せ方」と「解釈のサポート」です。
自宅版（Gut V2）のレポートは、検査結果20項目とアドバイスで構成されます。2024年1月の大型アップデートで項目数が従来の2倍に拡大しました。
プロ版（Gut V3/V4）は、自宅版の項目に加えて疾患リスク判定、初心者向けの腸内フローラガイド冊子、紙の結果レポートが付属します。
重要なのは、計測している菌そのものは共通という事実です。レポートの「体裁」と「解釈補助」が違うだけで、測っているデータの質に差はありません。
＼5分で注文完了・最新キットを自宅へ／
マイキンソーとプロどっちを選ぶか判断基準
腸活・美容・ダイエット目的なら自宅版、疾患リスクを医療従事者と見たい人はプロ版。迷ったら自宅版から始めて十分です。
「プロ版＝上位版だから高くても選ぶべき」という発想を捨て、自分のゴールから逆算するのが近道です。
腸活・美容目的なら自宅版
腸内環境の可視化、ダイエット、便秘・肌荒れ対策が目的なら、自宅版で十分です。
自宅版でわかるのは、ビフィズス菌・酪酸産生菌・エクオール産生菌・やせ菌・肥満菌の保有割合など。自分の体質を知り、食事や習慣を変えるための材料としては必要十分です。
通販で完結するため時間と手間もかかりません。
「豆乳を飲んでも体感が出ない」「何をしても便通が整わない」といった悩みの原因を、まず数値で把握する用途にピッタリです。
疾患リスク重視ならプロ版
IBS・高血圧・糖尿病・大腸がんのリスク傾向を、医師や管理栄養士と一緒に確認したい人向けです。
健康診断や人間ドックのオプションとして組み込むと効率的。結果を医師と共有しながら、食事指導や生活習慣のアドバイスをセットで受けられます。
ただし、プロ版の疾患リスク判定は統計的な傾向推定であって、確定診断ではありません。
「診断が欲しい」のか「傾向を知りたい」のか、目的をはっきりさせてから選んでください。
迷ったら初手は自宅版一択
判断に迷うなら、最初の1回は自宅版で十分です。
- 価格差：自宅版19,800円に対し、プロ版は22,000円〜。通院の手間と予約も必要
- 情報量は十分：自宅版でも腸内フローラ判定（5段階）と主要菌の保有割合はわかる
- 併用できる：自宅版を受けた後で疾患リスクを知りたくなれば、そこからプロ版に進める
今日注文すれば、3〜4週間後には自分の腸内が見えます。
行動を止めているのは「プロ版を受けるべきか」という迷いそのもの。まず自宅版で現状を把握するのが、最短の腸活ルートです。
＼併用もOK・まず自宅版から／
マイキンソーとプロの価格を徹底比較
自宅版は19,800円の固定価格、プロ版は22,000〜30,000円前後の医療機関ごとの自費料金です。価格差は年1回継続した場合に無視できない差になります。
まずは全体像から。主要な価格差を一覧に整理します。
| 比較項目 | マイキンソー（自宅版） | マイキンソー プロ |
|---|---|---|
| 定価（単発） | 19,800円（税込） | 22,000〜30,000円前後 |
| 保険適用 | なし（全額自己負担） | なし（自費診療） |
| キャンペーン | 公式通販で定期的にポイント20倍など | なし（医療機関の価格固定） |
| 送料 | 公式通販は条件付き無料 | 通院コストあり |
| 支払いタイミング | 注文時 | 医療機関による（多くはキット受領時） |
ネット上で「プロ版19,800円〜」と記載する情報を見かけますが、公開料金を確認した限り、実際の下限は22,000円です（2026年4月時点）。
自宅版の公式定価（税込）
マイキンソー公式通販での定価は19,800円（税込）で、2026年4月時点も据え置きです。
料金にはキット一式、ガイドブック、返送用封筒、Webマイページでの結果閲覧がすべて含まれます。追加料金は発生しません。
公式通販では定期的にポイント還元キャンペーンが実施されており、たとえば「腸内フローラの日キャンペーン」では20倍のポイント還元が設定されます。
タイミングが合えば実質的な支払いを抑えられます。
送料は購入チャネルによって異なります。公式通販は10,000円以上で送料無料になるケースがあるため、実質の自己負担は19,800円ちょうどと見ておくとよいでしょう。
プロ版の相場レンジ（22,000〜30,000円）
プロ版は医療機関が自由に料金を設定する自費診療。公開されている相場は22,000〜30,000円前後です。
公開実例としては、ライフクリニック蓼科（長野）が22,000円（税込・栄養指導含む）。プロ単独で実施する場合は別途3,500円が加算されます。
医療機関によっては30,000円前後まで上がるケースもあります。
価格が変動する主な要因は、栄養指導の有無と診察回数です。「検査キット＋結果説明＋栄養指導」をフルパッケージで提供する施設は料金が高めになります。
サイキンソー社の公式見解としても、「プロ版の料金は医療機関ごとに異なる」と明記されています。
正確な料金を知りたい場合は、受ける予定の医療機関に直接問い合わせてください。
Amazon・楽天と公式通販の値段差
自宅版はどこで買っても基本19,800円。大きな値段差はありません。ただし、ポイント還元の仕組みが違います。
公式通販は会員向けの独自ポイントとキャンペーンクーポンがあります。新規会員登録で500ポイントが付与され、誕生日クーポンやレビュー投稿ポイントなども利用可能です。
Amazonや楽天では、各モールのポイント還元が乗ります。楽天スーパーセールやAmazonプライムデーのタイミングで買うと、実質負担を抑えやすくなります。
どのチャネルで買っても検査キット自体は同じです。自分がよく使うモールで、ポイントが乗るタイミングを狙うのが合理的な買い方です。
年1回継続した場合の年間コスト
長く続けるなら自宅版のほうが経済的です。3年で6,600〜30,600円の差が生まれます。
サイキンソー社は、年1回程度の定期的な腸内フローラ測定を推奨しています。腸内環境は食事・体調・ストレスで変化するため、定点観測で変化を追うのが腸活の本質だからです。
| 継続期間 | 自宅版（年19,800円） | プロ版（年22,000〜30,000円） | 差額 |
|---|---|---|---|
| 1年 | 19,800円 | 22,000〜30,000円 | 2,200〜10,200円 |
| 2年 | 39,600円 | 44,000〜60,000円 | 4,400〜20,400円 |
| 3年 | 59,400円 | 66,000〜90,000円 | 6,600〜30,600円 |
プロ版には通院の時間コストも上乗せされます。「年1回のモニタリング」なら、自宅版のほうがコスパで圧倒的に有利です。
＼年1回モニタリングに最適／
マイキンソープロが上位版ではない3つの理由
プロは「医療機関向けパッケージ」であって、解析技術そのものは自宅版と共通の16S rRNA解析です。「プロ＝精度が高い」という期待は誤解です。
多くの比較記事が「プロ版＝高級版」として扱いがちですが、プロ版が自宅版より優れているのは一部の要素だけ。検査の本質部分は同じです。
検査基盤は16S rRNAで共通
自宅版もプロ版も、採用しているシーケンス技術は第2世代シーケンサーによる16S rRNA解析です。
使用している機械はイルミナ社のMiSeq System。同じ機械で、同じ遺伝子領域（16S rRNA）を読んで、同じ菌を検出しています。サイキンソー社の公式サイトでも明記されています。
つまり「プロ版だから遺伝子解析の精度が上がる」わけではありません。
読み取っているデータそのものに、自宅版との差はないのです。
現在は、第2世代より高精度な「第3世代解析（種レベルまで可視化）」を採用した検査サービスも登場しています。
疾患リスク判定は診断ではない
プロ版の疾患リスク判定は「統計的な傾向推定」であって、医学的な診断ではありません。
IBS・高血圧・糖尿病・大腸がんのリスク判定は、腸内フローラデータと生活習慣アンケートから算出した傾向スコアです。医師による確定診断ではありません。
ここを誤解すると、判断を大きく誤ります。
注意
「プロ版で大腸がんがわかる」と誤解すると、重大な判断ミスにつながります。医療的な確定診断を求めるなら、大腸内視鏡検査など別途の専門検査が必要です。
プロ版の疾患リスク判定は、あくまで腸活の方向性を決める参考情報として使うのが正しい向き合い方です。
管理栄養士相談は施設ごとに異なる
プロ版の「専門家アドバイス」の手厚さは、導入医療機関によってバラつきがあります。
施設によっては栄養指導が15分程度の短時間で終わるケースもあります。ライフクリニック蓼科では、15分を超えるカウンセリングには別途料金が発生します。
一方、サイキンソー社がプロ版受検者全員に提供する無料コールセンター「腸活ご相談コール」は、どの医療機関で受けても利用可能。施設の提供内容に関わらず、管理栄養士へ電話で質問できます。
「プロ版を受ければ必ず手厚い相談が受けられる」という期待は、施設によって裏切られる可能性があります。
受ける前に、栄養指導の時間と費用を医療機関に確認してください。
＼属レベル解析は自宅版でもOK／
マイキンソー自宅版の申込手順
公式通販で注文、届いたキットで採便して返送、3〜4週間後にマイページで結果を閲覧する3ステップです。
申込から結果閲覧まで、迷うポイントはほとんどありません。
公式通販サイトで購入する
マイキンソー公式通販（store.mykinso.com）、Amazon、楽天のいずれかで注文します。
公式通販は最新版キットが確実に届き、会員ポイントやキャンペーンも利用できるため、迷ったら公式が無難です。
注文から発送までは通常2〜3営業日。受け取り後、マイページ登録とWebアンケート（食生活や体調）を入力します。
アンケート内容は結果レポートの個別アドバイスに反映されるため、丁寧に答えてください。ここで手を抜くと、もらえるアドバイスの精度が下がります。
検査キット到着後に採便・返送
キットには採便キット、採便シート、チャック付きポリ袋、ガイドブック、返送用封筒が入っています。
ガイドブックの手順どおり自宅で採便し、専用の保存液に入れるだけ。採便後は1週間以内の返送が目安で、ポスト投函で完結します。
ただし、採便を避けるべきタイミングがあります。
注意
便秘中や抗生物質を服用中の採便は避けてください。抗生物質は腸内細菌叢を大きく変動させるため、最低2週間あけてからの検査がサイキンソー社で推奨されています。
体調が整ったタイミングで採便するほど、正確なベースラインが取れます。
3〜4週間後に結果レポート閲覧
検体がラボに到着してから、約3〜4週間後に結果がマイページで閲覧可能になります。
確認できるのは、20項目の検査結果、腸内フローラ判定（A〜Eの5段階）、個別菌の解説と腸活アドバイスなど。スマホでも見やすい設計です。
検査キットには使用期限があります。
未使用の状態で最低10か月は保管可能ですが、受け取ったら早めに採便するのが安心です。
＼申込から採便まで迷わない／
マイキンソープロを受けられる医療機関の探し方
サイキンソー公式サイトの導入医療機関検索で絞り込み、電話予約から結果受領まで約6週間かかります。
プロ版を選ぶ場合、医療機関選びと支払いタイミングだけは事前に把握してください。
公式サイトの導入医療機関検索
サイキンソー社の公式サイトに、全国1,500件（2025年時点）の導入医療機関一覧があります。
検索は都道府県で絞り込む形式。自宅や職場の近くから、通いやすい施設を選びます。
予約は各医療機関に直接電話するか、Webサイトから問い合わせてください。
選ぶときのコツは、栄養指導の有無・時間・費用を事前に確認すること。「プロ版22,000円だと思っていたら、栄養指導別料金で30,000円になった」というケースを避けられます。
電話予約から結果受領まで約6週間
プロ版の一般的な流れは、初回受診で検査キットを受け取り、3か月以内に自宅で採便・郵送、解析約3週間、医療機関または自宅へ結果送付、という順序です。
通院は基本2回。初回の検査キット受領と、結果説明のための再受診です。
最終的な結果受領までは、検査から概ね6週間ほどかかります。
自宅版の3〜4週間と比べると、プロ版は2倍近い期間が必要です。「急いで結果を知りたい」なら、自宅版のほうが合います。
自費診療の支払いタイミング
プロ版は自費診療扱いのため、健康保険は使えません。全額自己負担です。
支払いのタイミングは医療機関ごとに異なりますが、多くは初回の検査キット受領時にまとめて決済します。
数万円の出費は純粋な自己負担として計算してください。
通院の手間を省きたい場合は、自宅版で同じ解析基盤の検査が受けられます。通院不要の自宅版はマイキンソー公式で詳細確認できます。
マイキンソーとプロに関するよくある質問
マイキンソーとプロの比較で検索経由で多い5つの質問に、編集部がそれぞれ回答します。
- マイキンソー プロから自宅版に乗り換えできますか？
-
乗り換えは自由にできます。プロ版で疾患リスクを確認した後、経過観察は自宅版で年1回モニタリングするという使い方は合理的です。ただし、自宅版とプロ版でマイページのアカウントが分かれるケースがあるため、データの継続性については、購入前にサイキンソー社のサポートへ確認するのが確実です。
- マイキンソーとマイキンソー プロは保険適用されますか？
-
どちらも保険適用外で、全額自己負担です。プロ版は医療機関で受けますが、自費診療のため公的医療保険の対象になりません。腸内フローラ検査は現時点で、保険診療の対象となっていません。
- 「マイキンソーは意味ない」という口コミは本当ですか？
-
「意味ない」という口コミの多くは、検査結果を受け取った後に生活習慣を変えなかった人の感想です。検査はあくまで「現状の可視化」であり、結果から食事や運動を見直して初めて変化が見込めます。科学的には国内1,500の医療機関で採用されるなど信頼性は高く、「意味があるかどうかは受けた人の行動次第」が正確な評価です。
- マイキンソー プロとchatFLORA Gはどう違いますか？
-
マイキンソー プロは第2世代シーケンサーで16S rRNA解析、菌の属レベルまでを可視化し、疾患リスク判定4項目つきで医療機関限定です。chatFLORA Gは第3世代解析で種レベルまで可視化し、7カテゴリ39項目（ダイエット・メンタルヘルス・アレルギー・睡眠・栄養素・エクオール・疾患リスク）を通販で受けられます。解析精度とカテゴリの豊富さを求めるならchatFLORA G、医療機関で医師と相談したいならプロ版という使い分けです。
- マイキンソーは何年ごとに受けるのが良いですか？
-
サイキンソー社は年1回程度の定期検査を推奨しています。腸内環境は食事・ストレス・生活習慣で日々変化するため、定点観測で変化を追うのが有効です。生活習慣を大きく変えた後は、3〜6か月後に再測定して変化を確認するのもおすすめです。
「プロ版と第3世代解析のchatFLORA Gで迷っている」という方は、公式で検査内容を確認してから判断するのが確実です。
＼第3世代解析・7カテゴリ39項目／
マイキンソーとプロの違いを踏まえた最終判断
腸活入門は自宅版、疾患リスク重視はプロ版、最新の第3世代解析を試したいならchatFLORA Gが選択肢です。
前提知識なしで選ぶなら、19,800円の自宅版からで迷う必要はありません。
腸活入門ならマイキンソー自宅版
はじめての腸内フローラ検査なら、自宅版で決まりです。
19,800円、通販完結、3〜4週間で結果。この手軽さは他の選択肢にはありません。
今の腸内状態を知らないまま腸活を続けるのは、地図を見ずに山登りをするようなもの。
自宅版で腸内のベースラインを把握してから、食事や運動、サプリを調整していく。腸活の王道ルートです。
疾患リスク重視ならプロ版
IBS・高血圧・糖尿病・大腸がんのリスク傾向を医師と一緒に確認したい人にプロ版がフィットします。
健診や人間ドックとのセットで受けると効率的。医師との対話を前提にする人には、プロ版の「結果説明＋栄養指導」のパッケージが活きます。
料金は医療機関ごとに22,000〜30,000円と幅があります。受ける前に、栄養指導の時間と費用を直接確認してください。
第3世代検査ならchatFLORA Gも比較
「もっと詳しく知りたい」「最新技術で測りたい」ならchatFLORA Gが有力候補です。
マイキンソー（プロを含む）は第2世代シーケンサーの16S rRNA解析で、菌の属レベルまでを可視化。chatFLORA Gは最新の第3世代解析で、種レベルまで可視化できます。
カテゴリは7つで39項目。ダイエット・エクオール・メンタルヘルス・アレルギー・栄養素・疾患リスク・睡眠をカバーします。
疾患リスク項目はプロ版の4項目に対し12項目と幅広く、メンタルヘルスや睡眠まで踏み込むのはchatFLORA Gの強みです。
＼2026年4月は6,000円OFF／
2025年9月発売の比較的新しいサービスで、解析精度とカテゴリの豊富さを重視する層に刺さります。
- マイキンソーとプロの違いは5点（購入場所・価格・疾患リスク判定・専門家解説・レポート項目数）
- 検査基盤は16S rRNA解析で共通。解析精度そのものに差はない
- 自宅版19,800円／プロ版22,000〜30,000円と価格差は2,200〜10,200円
- 疾患リスク判定4項目はプロ版のみだが、医学的確定診断ではない
- 迷ったら自宅版一択。詳細な解析精度を求めるならchatFLORA G
＼腸活入門の最短ルート／
＼種レベル解析・メンタルも診断／
参考情報・関連機関
【監修】
栄養・食事の観点：管理栄養士
医学・臨床の観点：消化器内科医
