2026年4月は『chatFLORA G』が6,000円オフのキャンペーン中です。詳細はこの下で説明します。
結局どっちを選べばいいか、基準がわからない。
編集部目的によって答えが変わります。解析の深さか実績か、2つの軸で整理します。
↓徹底比較の結論
単品価格は2サービスとも19,800円（税込）で同額ですが、中身は大きく違います。
検査項目数は39項目と約10項目で、約4倍の開きがあります。
19,800円の価格ハードルは高めですが、2026年4月に買うなら注意してください。
『chatFLORA G』が6,000円オフのキャンペーン中だからです。
腸内フローラ検査キットの割引は頻繁に実施されているものの、
割引額は2,000円前後が相場です。
19,800円の検査キットが約13,800円で手に入ります。
解析の深さと情報量を優先したい方にはベストなタイミングです。
＼2026年4月は6,000円オフ／
とはいえ、累計20万件超の検査実績を持つ『マイキンソー』は、初めての腸活や結果の読み解きサポートを重視する方に適しています。
管理栄養士への無料相談が検査料19,800円に含まれます。
検査結果の理解から日々の行動への落とし込みまで、追加費用なしで回せる設計です。
＼管理栄養士への無料相談が検査料に含まれる／
chatFLORA Gとマイキンソー比較の結論
解析精度ならchatFLORA G、実績と安心感ならマイキンソーが強みで、どちらを選ぶかは目的次第です。
どちらも自宅で採便するだけで腸内環境を数値化できますが、採用している解析技術の世代が根本的に違います。chatFLORA Gは最新の第3世代シーケンサーを採用し、種レベルの高精度な解析が可能です。
マイキンソーは累計20万件超の検体データベースと理化学研究所との共同研究を背景に、統計的な信頼性の高い比較ができます。「解析の深さ」か「実績の厚みと専門家サポート」か、その一点で選び方が変わります。
マイキンソーの検査で何がわかるのか、実際のレポートイメージについてはこちらの紹介動画が参考になります。
精度・項目・価格の3軸比較表
chatFLORA Gは検査の「深さ」、マイキンソーは検査の「安心感」に強みがあります。
両サービスの主要スペックをまとめました。全体像を把握したうえで、後続のセクションで各項目を掘り下げます。
| 比較項目 | chatFLORA G | マイキンソー |
|---|---|---|
| 運営会社 | 株式会社KEAN Health | 株式会社サイキンソー |
| 解析方式 | 第3世代（種レベル） | 第2世代・16S rRNA（属〜門レベル） |
| 検査項目数 | 39項目・7カテゴリー | 約10項目・7カテゴリー |
| 痩せ菌検出 | 3種類（個別検出） | FB比（傾向判定） |
| エクオール産生菌 | ○（種レベル特定） | ○（割合表示） |
| 通常価格（税込） | 19,800円 | 19,800円（まとめ買い割引あり） |
| 定期コース | あり（4種類） | なし（都度購入のみ） |
| 結果返却期間 | 検体受領後3〜4週間 | 検体受領後4〜6週間 |
| 累計実績 | 2024年発売（クラファン発） | 累計20万件超 |
| 研究機関連携 | ー | 理化学研究所・大阪大学 |
| 管理栄養士相談 | なし | あり（腸活ご相談コール） |
初めての検査で全体像を把握したいなら、マイキンソーの実績と相談サービスが選ぶ理由になります。解析項目の多さと技術の新しさを重視するなら、chatFLORA Gが候補に上がります。
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結果レポートの表示形式の違い
chatFLORA Gは「何を改善すべきか」を示す設計、マイキンソーは「腸内環境の全体像」を把握する設計です。
検査結果の見せ方には、両者で明確な方向性の違いがあります。事前に把握しておくと、結果を受け取ってから迷わずに済みます。
chatFLORA Gは7カテゴリーそれぞれのスコアを表示します。ダイエット・メンタルヘルス・エクオール・アレルギー・栄養素・疾患リスク・睡眠という7つの切り口で腸内フローラを評価し、食事アンケートと連動したパーソナライズされた腸活アクションプランも提示されます。
マイキンソーはA〜Eの5段階で総合判定を出します。ビフィズス菌・乳酸産生菌・酪酸産生菌・エクオール産生菌の個別割合と、太りやすさ・便秘や下痢のタイプ判定も含まれます。
さらに管理栄養士への相談サービス（腸活ご相談コール）が付帯しているため、結果の読み方に迷ったときにすぐ専門家へ確認できます。
chatFLORA Gは情報量が多い分、自分で結果を読み解く力が求められます。マイキンソーは全体像が直感的に分かり、専門家のフォローもあります。
どちらが向いているかは、使い方のスタイル次第です。全体像をまずつかみたい方は、マイキンソーの公式サイトで検査内容を確認してみてください。
chatFLORA Gとマイキンソーの解析精度を比較
chatFLORA Gは種レベル、マイキンソーは属〜門レベルの解析で、検出できる菌の粒度が根本的に異なります。
解析方式の違いは「どれほど細かく菌を識別できるか」に直結します。各方式の仕組みを順に整理します。
16S rRNA部分配列と全長配列の違い
マイキンソーは遺伝子の「一部」を読む方式、chatFLORA Gは「全長」を読む方式です。
腸内フローラ検査は、腸内細菌が持つ「16S rRNA遺伝子」という特定の遺伝子配列を読み取ることで菌の種類を特定します。この遺伝子の全長はおよそ1,500塩基対（bp）あります。
マイキンソーが採用する第2世代シーケンサーは、遺伝子の一部の可変領域（V3-V4領域など、約500bp）だけを読み取ります。「本の数ページだけを読んで内容を判断する」イメージです。
属（genus）レベルまでの同定精度は高く再現性も安定していますが、近縁種の区別がつかないケースがあります。
chatFLORA Gが採用する第3世代シーケンサーは、同じ遺伝子の全長(1,500bp)を一度に読み取れます。「本を最初から最後まで全部読む」方式で、第2世代では区別できなかった近縁種を種レベルで識別できます。
ただし、一点補足しておきます。
つまり両者は「どちらが優れているか」ではなく、「分析の粒度が違う」と理解するのが正確です。
腸内フローラ解析の仕組みや、細菌が私たちの健康にどう関わっているのかについては、こちらの専門動画でさらに詳しく解説されています。
検査項目数とカテゴリーの違い
chatFLORA Gは39項目・7カテゴリー、マイキンソーは約10項目・7カテゴリーで、項目数の差は「情報量」より「分析の深さ」の違いです。
chatFLORA Gの39項目は、以下の7カテゴリーに分類されています。
- ダイエット（5項目）：痩せ菌3種（クリステンセネラ・アッカーマンシア・ブラウティア）、肥満菌、食欲菌
- エクオール（1項目）：エクオール産生菌
- メンタルヘルス（4項目）：うつ病・活力・セロトニン・ドーパミン
- アレルギー（2項目）：アレルギー性鼻炎・アトピー性皮膚炎
- 栄養素（13項目）：ビタミンB群7種・ビタミンK2・短鎖脂肪酸3種・乳酸
- 疾患リスク（12項目）：大腸がん・2型糖尿病・高血圧・IBD・慢性疲労症候群など
- 睡眠（2項目）：睡眠の質・入眠後覚醒回数
マイキンソーの約10項目は7カテゴリーに対応します。健康長寿・ダイエット・美容・免疫・便秘・運動・不健康な習慣の7つの切り口で評価します。
ビフィズス菌・乳酸産生菌・酪酸産生菌・エクオール産生菌の割合と、菌の多様性・FB比が確認できます。
項目数だけで判断しないことが重要です。マイキンソーは項目数が少ない分、各項目のレポート解説が手厚く、管理栄養士への相談も受けられます。
chatFLORA Gは39項目のデータが出る分、自分で読み解く力が求められます。「腸内環境の全体像を広く知りたい」ならマイキンソー、「特定のテーマを深く掘り下げたい」ならchatFLORA Gが向いています。
エクオール産生菌の検出精度
エクオール産生菌の有無を「知る」だけならどちらでも十分で、「菌種まで特定」したいならchatFLORA Gが有利です。
エクオールは大豆イソフラボンが腸内細菌によって変換されてできる物質で、更年期症状の緩和に関わるとされています。このエクオールを産生できるかどうかは腸内細菌の有無で決まり、日本人女性の約半数がエクオール産生菌を持っていないといわれています。
両サービスともエクオール産生菌の検出に対応していますが、表示方法が異なります。
chatFLORA Gは第3世代の種レベル解析により、エクオール産生に関与する具体的な菌種の有無と量を把握できます。マイキンソーはエクオール産生菌の「割合」を表示する方式で、産生菌の有無は分かりますが菌種の特定までは踏み込みません。
「まず自分がエクオールを産生できるかどうかを知りたい」という目的なら、どちらのサービスでも判断できます。どの菌種が産生を担っているかまで知りたい場合は、chatFLORA Gが有利です。
解析技術の詳細や検査項目が気になる方は、chatFLORA Gの公式サイトで確認してみてください。
＼第3世代シーケンサー・種レベル解析／
chatFLORA Gとマイキンソーの信頼性を比較
マイキンソーは累計20万件超の実績と理化学研究所との共同研究が強みです。chatFLORA Gは解析技術の新しさが強みですが、腸内フローラ検査としての実績はこれからです。
解析精度がどれほど高くても、蓄積された比較データが少なければ「あなたの腸内環境が平均と比べてどうか」を正確に示せません。技術の新しさと実績の厚みの両方から、2社を見ていきます。
chatFLORA Gの運営会社と実績
chatFLORA Gは遺伝子検査で280万件超の解析実績を持つKEAN Healthが運営しており、腸内フローラ検査としての実績はこれからです。
chatFLORA Gを運営するのは株式会社KEAN Healthです。東京都港区芝浦に所在し、遺伝子検査ブランド「chatGENE」を展開しています。
chatGENEは累計解析280万件以上の遺伝子検査サービスです。GeneLife（ジェネシスヘルスケア）のブランド再編を経て誕生しました。
chatFLORA Gは2024年に発売された新しいサービスです。発売前のクラウドファンディングでは目標額の約190%を達成し、chatGENEユーザー向けテスト販売では3時間で1,800個が完売しました。
注目度の高さは示していますが、腸内フローラ検査としての検体蓄積データ数は非公表です。統計的な比較母集団のサイズという点では、マイキンソーの20万件超に対して大きく劣ります。
一方で倫理委員会を設置し、腸内細菌検査申込同意書や研究協力説明書を公開するなど、運用の透明性は確保されています。
マイキンソーの研究基盤と累計実績
マイキンソーは累計20万件超・理化学研究所認定ベンチャー・医療機関300施設以上が導入という3つの数字が信頼性を支えています。
マイキンソーを運営する株式会社サイキンソーは、理化学研究所認定ベンチャーです。累計検体数は20万件を超えており、国内の腸内フローラ検査サービスでトップクラスの実績を持ちます。
この検体データベースが、統計的な比較精度を支えています。共同研究先には理化学研究所と大阪大学微生物病研究所が名を連ねます。
医療機関向けサービス「Mykinso Pro」は約300以上の医療機関に導入されています。また情報セキュリティマネジメントシステムの国際規格であるISO/IEC 27001を2017年に取得しており、個人情報管理の信頼性も担保されています。
さらに外部専門家からの評価も確認できます。
加えて検査はすべて自社ラボで実施しており、外部委託ではないため品質管理が一元化されています。実績と研究基盤の両面で、現時点ではマイキンソーが大きくリードしていると判断できます。
＼理化学研究所認定ベンチャー・自社ラボで品質管理／
chatFLORA Gとマイキンソーの料金を比較
単品価格は両サービスとも19,800円(税込)で同額です。継続検査を前提とするなら、マイキンソーのまとめ買い割引とchatFLORA Gの定期コースをそれぞれ比較したうえで選んでください。
1回だけ試したいのか、継続的に腸内環境の変化を追いたいのかで、コスト比較の結果が大きく変わります。購入前に、どちらのパターンかを明確にしておくことが重要です。
都度購入の1回あたり単価
都度購入なら、chatFLORA G・マイキンソーともに19,800円(税込)で単品価格は同額です。
chatFLORA Gの通常価格は税込19,800円です(2026年4月時点、公式サイト確認)。過去には13,800円のキャンペーンを実施した実績があります。
マイキンソーは公式サイトで19,800円（税込）です（2026年4月時点）。2個セット17,600円・3個セット16,500円・4個セット15,400円（各1個あたり）とまとめ買い割引があります。
単品価格は同額ですが、検査項目数はchatFLORA Gが39項目・マイキンソーが約10項目という差があります。1項目あたりの単価に換算すると、chatFLORA Gは約508円・マイキンソーは約1,980円となり、情報量のコスパではchatFLORA Gが優位です。
ただし「項目数が多いから良い検査」ではなく、自分の目的に合った項目があるかどうかで判断するのが正しい選び方です。
以下の表で主要スペックをまとめました。結果の返却期間にも違いがあるため、あわせて確認してください。
| 比較項目 | chatFLORA G | マイキンソー |
|---|---|---|
| 通常価格（税込） | 19,800円 | 19,800円 |
| まとめ買い割引 | なし（定期コースあり） | あり（2〜4個セット、最大22%OFF） |
| 検査項目数 | 39項目 | 約10項目 |
| 1項目あたり単価 | 約508円 | 約1,980円 |
| 結果返却期間 | 検体受領後3〜4週間 | 検体受領後4〜6週間 |
早く結果を受け取りたい場合はchatFLORA Gが若干有利です。ただし返却期間だけでなく、検査内容と目的の合致度も必ず確認してください。
定期・継続コストの比較
chatFLORA Gには4種類の定期コースがあり継続検査のコストが大幅に下がりますが、各コースに「お約束回数」があり途中解約は原則不可です。
chatFLORA Gの定期コースの内訳は以下のとおりです（特商法ページで確認）。
| コース名 | 配送頻度 | お約束回数 |
|---|---|---|
| 毎月コース | 毎月 | 12回（12か月） |
| 2か月ごとコース | 2か月ごと | 6回（12か月） |
| 3か月ごとコース | 3か月ごと | 4回（12か月） |
| 4か月ごとコース | 4か月ごと | 3回（12か月） |
毎月コースの1回あたり料金については、公式LPが画像レンダリング形式のため編集部では直接確認できていません。申し込み前に必ず公式LPで最新料金を確認してください。
コスト面で見ると、3回検査した場合の単純計算ではマイキンソーの都度購入59,400円に対し、3個セット購入なら49,500円（16,500円/個）になります。chatFLORA Gは定期コース利用でおおむね33,000円前後の見込みです（初回料金の適用条件は公式LPで確認）。
ただし、解約条件には注意が必要です。
解約に関する注意
各コースはお約束回数分を受け取るまで原則解約できません（特商法ページより確認）。毎月コースなら12回、2か月ごとコースなら6回の受け取りが必要です。お約束回数を完了後、次回お届け予定日の1日前までにマイページから解約手続きができます。
定期的に腸内環境の変化を追いたい方にはchatFLORA Gの定期コースがコスト優位ですが、継続回数の縛りを十分に理解したうえで申し込んでください。
まず1回試したい方は単品価格が同額のため、目的と検査項目の合致度で選ぶほうが合理的です。マイキンソーには継続コースがなく、複数回検査する場合はまとめ買い割引（最大22%OFF）の活用が選択肢になります。
＼定期コース4種類・継続検査のコストを抑えたい方に／
目的別で選ぶchatFLORA Gとマイキンソー
痩せ菌の種類を菌レベルで知りたい方はchatFLORA G、初めての腸活で全体像を把握したい方はマイキンソーが適しています。
比較表を見ても「自分にはどちらが合うかわからない」という方のために、目的別に整理します。
痩せ菌3種を詳しく知りたい方
痩せ菌を菌種レベルで個別に検出できるのはchatFLORA Gだけで、「自分に痩せ菌がいるかどうか」を具体的に確認できます。
マイキンソーはFB比（ファーミキューテス門とバクテロイデーテス門の比率）として痩せ体質の傾向を判定します。「痩せやすいタイプか太りやすいタイプか」の全体的な傾向は分かりますが、特定の菌種の有無は分かりません。
chatFLORA Gは痩せ菌を3種類（クリステンセネラ、アッカーマンシア・ムシニフィラ、ブラウティア・ウェクスレラエ）それぞれ個別に検出します。「クリステンセネラが少ないから発酵食品を意識する」といった菌種レベルの腸活戦略を立てやすくなります。
ひとつ前提として伝えておきます。
菌種レベルで詳しく知りたい方は、chatFLORA Gの公式サイトで痩せ菌の検査内容を確認してみてください。
＼痩せ菌3種を菌種レベルで個別検出／
更年期・エクオール対策を考えている方
エクオール産生菌の有無を「まず知る」目的なら、どちらのサービスでも判断できます。
エクオールは大豆イソフラボンが腸内細菌によって変換されてできる物質で、更年期症状の緩和に役立つ可能性があるとされています。産生できるかどうかは腸内細菌の有無で決まり、日本人女性の約半数がエクオール産生菌を持っていないといわれています。
まず自分の産生菌の有無を確認することが、対策を考える最初のステップです。
エクオール産生菌がいない場合、サプリメントでの補給が選択肢のひとつになります。検査で産生菌の有無を確認してから、対策を考えることが合理的です。
両サービスともエクオール産生菌の検出に対応していますが、表示方法が異なります。chatFLORA Gは種レベルで産生に関与する菌種の有無と量を特定し、マイキンソーは産生菌の割合を表示します。
「産生菌がいるかどうか」を確認するだけならマイキンソーで十分です。どの菌種が産生を担っているかまで知り、どの発酵食品が自分に合いそうかを把握したいなら、chatFLORA Gがより詳しい情報を提供します。
更年期対策として腸内フローラ検査を始めたい方は、マイキンソーの公式サイトでエクオール産生菌の検査内容を確認してみてください。
初めての腸活で全体把握したい方
初めての腸内フローラ検査なら、管理栄養士への相談サービスが付いているマイキンソーが安心です。
初めて検査を受ける方が最初に知りたいのは「自分の腸内環境が良いのか悪いのか」という全体像のはずです。マイキンソーのA〜Eの5段階判定は直感的で分かりやすく、「自分はCランクだから改善が必要」という行動の起点として機能します。
加えて管理栄養士への相談サービス（腸活ご相談コール）が付帯しているため、結果を見て「どこから手をつければいいか分からない」という状況でも専門家に確認できます。
chatFLORA Gは39項目の詳細データが提供されますが、情報量の多さが初心者には負担になる可能性があります。
段階的に進める方法もあります。
初めての検査で迷った方は、実績と相談サポートが整ったマイキンソーからスタートするのが最もリスクの少ない選択です。
＼A〜E5段階判定・結果の読み方に迷わない／
マイキンソーの検査内容・管理栄養士相談を公式サイトで確認する
マイキンソーから乗り換えを検討している方
マイキンソー経験者がchatFLORA Gに移行する場合、「乗り換え」より「使い分け」の発想が合理的です。
マイキンソーを受けたことがあり「もっと詳しく知りたい」「項目が物足りない」と感じた方がchatFLORA Gを検討するケースがあります。chatFLORA Gの第3世代解析では、マイキンソーでは見えなかった菌種を検出できる可能性があります。
特に痩せ菌3種の個別検出、メンタルヘルスや睡眠に関わる菌の分析はマイキンソーにはない項目です。疾患リスク12項目（過敏性腸症候群・慢性疲労症候群・非アルコール性脂肪性肝疾患など）もchatFLORA G独自の強みです。
マイキンソーで全体像を把握し、chatFLORA Gで特定の菌を深掘りするという使い方は合理的です。両方を同時期に受けて結果を見比べると、解析方式の違いによる見え方の差も理解しやすくなります。
詳細な解析を求めてchatFLORA Gへの移行を検討している方は、chatFLORA Gの公式サイトで検査項目・解析内容を確認してみてください。
よくある質問
chatFLORA GとマイキンソーについてよくいただくQ&Aをまとめました。
- chatFLORA Gとマイキンソーの検査結果はどちらが早く届く？
-
chatFLORA Gは検体受領後おおよそ3〜4週間でマイページに結果が表示されます（公式FAQより確認）。マイキンソーは検体受領後約4〜6週間です。
結果を早く確認したい場合はchatFLORA Gが若干有利ですが、返却期間だけでなく検査内容（項目数・解析精度）も合わせて判断することが重要です。
- chatFLORA Gとマイキンソーを両方受けて比較する意味はある？
-
解析方式が異なるため、両方受けると異なる角度から腸内環境を把握できます。マイキンソーで全体像を把握してから、chatFLORA Gで特定の菌を深掘りするという順番が合理的です。
ただし2つ合わせると約40,000円になります。目的が明確でない場合は、まずどちらか一方に絞るほうが失敗が少ないです。
- chatFLORA Gの定期コースは途中で解約できる？
-
各コースには「お約束回数」が設定されており、お約束回数分を受け取るまでは原則解約できません（特商法ページより確認）。毎月コースは12回、2か月ごとコースは6回の受け取りが必要です。
お約束回数を完了後、次回お届け予定日の1日前までにマイページから解約手続きができます。申し込み前に最低継続期間を公式LPまたは特商法ページで必ず確認してください。
- chatFLORA Gとマイキンソーの検査項目数はどのくらい違う？
-
chatFLORA Gは39項目（7カテゴリー）、マイキンソーは約10項目（7カテゴリー）です。項目数が多い＝優れているではなく、分析の深さと目的の違いを反映しています。
腸内環境の全体像を広く知りたいならマイキンソー、痩せ菌・メンタルヘルス・疾患リスクなど特定テーマを深掘りしたいならchatFLORA Gが向いています。
- 腸内フローラ検査キットを比較するときに重視すべきポイントは？
-
重視すべき軸は主に3つです。
- 解析精度と方式（第2世代か第3世代か）
- 検査項目の内容が自分の目的（ダイエット・更年期・メンタル・疾患リスクなど）に合っているか
- 結果の読みやすさとサポート体制（管理栄養士相談の有無など）
累計検査実績や研究機関との連携も信頼性の判断材料になります。価格だけで選ぶと「期待と違った」となりやすいため、まず目的を明確にすることが先決です。
まとめ
解析精度とカテゴリーの豊富さを求めるならchatFLORA G、実績と相談サポートを重視するならマイキンソーです。
2サービスの違いを3点に整理しました。
- chatFLORA Gは第3世代シーケンサーで種レベルの高精度解析を実現し、39項目・7カテゴリーの情報量が強み。痩せ菌3種の個別検出やメンタルヘルス・疾患リスクなど、マイキンソーにはない項目を網羅しているが、2024年発売と日が浅く腸内フローラ検査としての蓄積実績はこれから
- マイキンソーは累計20万件超の検体データベースと理化学研究所との共同研究を背景に統計的な信頼性が高い。管理栄養士への相談サービスも付帯しており、初めての検査でも結果の読み方に迷いにくい
- 初めて腸内フローラ検査を受けるなら、実績と相談サポートが充実したマイキンソーからスタートするのが最もリスクの少ない選択。マイキンソーで全体像を把握してから、必要に応じてchatFLORA Gで深掘りする順番が合理的
腸内フローラ検査は「受けて終わり」ではなく、結果を日々の食事や生活習慣に落とし込むことで意味を持ちます。
初めての検査で全体像をつかみ、専門家のサポートを受けながら腸活をスタートしたい方は、まずマイキンソーの公式サイトで検査内容を確認してみてください。
＼国内最多クラスの実績・初めての腸活にも安心／
参考情報・関連機関
